Вы - старший оперативный сотрудник F.E.A.R. Во время плановых учений, чувствуя легкое недомогание, вы обратились в медсанчасть за помощью. После того как врач ввел укол успокоительного, вы внезапно начали погружаться в темноту. В настоящий момент вам постепенно возвращается сознание. Вы не можете понять, где вы сейчас находитесь и какое сейчас время суток. Сюжет игры является продолжением сторилайна нашумевшего шутера F.E.A.R.. Ядерного взрыва оказалось недостаточно, чтобы покончить со злом, порожденным мистической аномалией.
В игре вам снова придется столкнуться с различными головоломками, сразиться с полчищами клонированных воинов и встретить призрак мертвой девочки Альмы. В игру включены новая кампания, 11 мультиплеерных карт, внедрен новый механизм взаимодействия ИИ в режиме боя.
Добавлены 2 вида оружия и 2 новых мультиплеерных режима. Исправлена ошибка оригинальной игры, которая не позволяла раньше запускать игру на системах с жестким диском FAT32.
Добавлена новая система регистрации сетевой игры, которая позволяет игрокам получить официальный регистрационный ключ, используя систему регистрации F.E.A.R. Combat, что дает возможность играть в Интернете, включая официальные сервера.
В игру включен последний официальный набор мультиплеерных карт, используется патч 1.08, исправляющий множество ошибок предыдущих версий игры.